La Junta Rectora està formada pel president, el secretari, el tresorer i set vocals, elegits per l'Assemblea de Socis per a un període de tres anys, i pels caps dels serveis tècnics de l'Associació.
La funció principal de la Junta Rectora és complir els objectius de l'Associació i dur a terme les accions concretes destinades a aquests objectius, amb la reserva de competències que correspon a les assemblees generals de socis d'acord amb aquests objectius. Durant l'any 2005 la Junta Rectora s'ha reunit un cop al mes.